Платформа «Яндекс.Дзен» отказалась рекламировать материалы «Открытых медиа», объяснив это «политической тематикой» публикаций. Запрет коснулся статьи, рассказывающей о расследовании Алексея Навального о недвижимости Юрия Трутнева, новости о патриархе Кирилле, который призвал московскую монахиню продать свой Mercedes за 9,5 млн рублей, и публикаций (1,2) о семье пресс-секретаря президента Дмитрия Пескова.

Эти статьи «Открытые медиа» в диалоге с техподдержкой сервиса привели в качестве примера материалов, которые хотели бы прорекламировать в «Дзене». Однако сотрудник техподдержки сообщил, что, хотя публикации «не нарушают требования к контенту», но тем не менее «не соответствуют требованиям к рекламируемым материалам, поскольку относятся к политической тематике».

В правилах, на которые ссылается служба поддержки «Яндекса», прописаны условия для отказа в рекламном продвижении. В «Дзене» нельзя рекламировать материалы, которые содержат предвыборную агитацию, рекламу сайтов депутатов, политических деятелей или их приёмных. Также нельзя продвигать за деньги опросы общественного мнения относительно выборов и референдумов и публикации, построенные на «обвинении, очернении и разоблачении».

Сотрудник службы поддержки «Яндекса» заверил ОМ, что никакого стоп-листа  В случае «Дзена» — это список изданий, с которыми сервис по каким-либо причинам не будет сотрудничать. Обычно подобные стоп-листы являются секретными, а сервисы, отказывая находящимся там лицам в обслуживании, часто ссылаются не на присутствие в этом списке, а на какие-то другие причины в «Дзене» нет. На вопрос о том, запрещена ли реклама любых новостей о политике, он не ответил.

Руководитель направления сторителлинга «Дзена» Никита Белоголовцев в разговоре с «Открытыми медиа» заявил, что никаких негласных правил модерации в сервисе не существует. От дальнейших комментариев от отказался, посоветовав обратиться в PR-департамент. Пресс-служба «Яндекса» переадресовала запрос ОМ относительно негласных запретов на рекламу обратно в техподдержку.

Как писали «Открытые медиа», в начале июня из другого сервиса компании — «Яндекс.Новостей» — пропали публикации о голосовании по поправкам к Конституции. В сервисе не отображались никакие новости по словам «голосование», «Конституция», «поправки», которые были опубликованы 1 июля — то есть в течение основного дня голосования, когда таких новостей было больше всего. Тогда в «Яндексе» произошедшее объяснили техническим сбоем.

В 2018 году «Яндекс.Дзен» ограничил выдачу пользователям материалов «МБХ медиа» из-за подробного описания сцен насилия в материалах о пытках в колониях, гибели военнослужащих и издевательствах над животными.